畸胎瘤属于良性肿瘤，以手术治疗为主，如果不能手术的病人，畸胎瘤对化疗也不敏感，我们没有畸胎瘤化疗的临床经验。

如果诊断是“恶性畸胎瘤”，治疗不同于畸胎瘤。事实上“恶性畸胎瘤”是胚胎学上生殖细胞瘤、自卵黄囊向生殖腺移行的各个区域中发生异常分化的结果，在病理上常无三胚层结构，通常认为不应归为畸胎瘤。

恶性畸胎瘤巨大或广泛浸润、临床判断不能切除者，可应用术前化疗或放疗，使肿瘤缩小后再予延期根治手术，对提高手术切除率、保留重要脏器有积极意义。