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免费Medline数据库检索 (4)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
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文献处理
1、显示
可以通过display下拉菜单选择显示方式。点击Show下拉菜单选择每屏的显示数目，再点击Display 按钮，PubMed 将重新按照新的命令进行显示。 点击选择页号显示结果，当前显示页号为红色，点击>> 可以查看以后的页号。PubMed 首先以summary 方式进行显示，各种显示格式所包括的内容如下： Summary — 包括：作者姓名、文章题目、出处、记录状态、语种、出版物类型、PMID。Brief — 包括：作者姓名、文章题目的前30个字母、PMID。Abstract —包括：出处、记录状态、文章题目、作者姓名、作者单位、文摘、出版物类型、缩写、注释、PMID等。 Citation —包括：出处、记录状态、文章题目、作者姓名、作者单位、文摘、出版物类型、缩写、注释、MeSH 词、化学物质名称、SI数据库索取号、基金号、PMID等。
2、保存
保存功能可以在你自己的计算机上创建文本文件，保存按钮可以保存当前屏幕上的结果，也可以保存所有的检索结果或选择保存。
3、打印
可以利用浏览器的打印键进行屏幕上内容的打印。如果要选择性地打印检索结果，可以先将所选的文献添加到Clipboard，然后再打印。
副主题词
副主题词(Subheadings)是由代表一些主题概念的MeSH词汇所组成，主要用来描述和限定检索词的主题领域（有关副主题词及其字段标识符见表1）。副主题词的字段标识符为[sh]。可以用Medline 的副主题词双字母缩写形式来检索，这样比采用全称检索更简便。例如：dh [sh]= diet therapy[sh]。
表 1 副主题词表及缩写形式
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副主题词名称 缩写 副主题词名称 缩写
--------------------------------------------------------------------------------
Abnormalities
Administration and Dosage
Adverse Effects
Agonists
Analogs and Derivatives
Analysis
Anatomy and Histology
Antagonists and Inhibitors
Biosynthesis
Blood Supply
Blood
Cerebrospinal Fluid
Chemical Synthesis
Chemically Induced
Chemistry
Classification
Complications
Congenital
Contraindications
Cytology
Deficiency
Diagnosis
Diagnostic Use
Diet Therapy
Drug Effects
Drug Therapy
Economics
Education
Embryology
Enzymology
Epidemiology
Ethnology
Etiology
Genetics
Growth and Development
History
Immunology
Injuries
Innervation
Instrumentation
Isolation and Purification
AB
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Manpower
Metabolism
Methods
Microbiology
Mortality
Nursing
Organization and Administration
Parasitology
Pathogenicity
Pathology
Pharmacokinetics
Pharmacology
Physiology
Physiopathology
Poisoning
Prevention and Control
Psychology
Radiation Effects
Radiography
Radionuclide Imaging
Radiotherapy
Rehabilitation
Secondary
Secretion
Standards
Statistics and Numerical Data
Supply and Distribution
Surgery
Therapeutic Use
Therapy
Toxicity
Transmission
Transplantation
Trends
Ultrasonography
Ultrastructure
Urine
Utilization
Veterinary
Virology
Legislation and Jurisprudence
MA
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检索实例：检索哮喘药物治疗方面的文献，可以用：
asthma/drug therapy 或asthma/dt[sh]或asthma[mh]AND drug therapy[sh]等方式进行。
副主题词检索将自动地包括其他的下位词，如副主题词Therapy包括的下位词有：Diet Therapy、Drug Therapy等。如果希望关闭自动扩展功能，可以用句法 [sh:noexp]来实现,例如：therapy[sh:noexp]。
其他功能
1、链接
其功能主要体现在两个方面：一是对PubMed系统以外的外部信息的链接(Links)；二是系统内部相关信息的链接。
（1）相关文献(Related Aricles)链接 检索结果中每条记录的右侧都有“Related Aricles”超链接，点击该链接可以显示与本次检索结果相关的更多文献。PubMed 创建相关文献链接，是依据所检索的核心概念在被命中记录以外的其他文献的题目、文摘和MeSH 词中出现的情况、运用一定的权值算法来确定的，并依据相关程度进行排序。此功能可以帮助用户获得更多的相关文献。
（2）外部链接(Links) PubMed允许出版商、信息集成者、图书馆、生物学数据库、序列中心等提供的Wed资源与Medline数据库中的记录建立链接，这些外部资源通过LinkOut来实现。LinkOut超链接使检索者可以到信息提供者的站点上获取更多的相关信息。被链接的外部站点资源主要是杂志的原文(有些需要付费才能获得)。
（3）链接到NCBI数据库 此功能将Medline数据库与NCBI分子生物学数据库有机地结合起来，在Medline数据库检索命中文献涉及到分子生物学数据库中的信息如基因序列、蛋白质结构等自动建立链接，使用户很方便地通过超链调出相关信息。
（4）链接图书信息(Books) 是NCBI与图书出版商合作，将有关图书改写成Web版本并将其链接到PubMed中。该功能主要是为用户在检索中遇到不熟悉的概念提供背景资料。对于一些新概念和词语将有超链直接链接到书中的相关信息处。
2、原文传递服务
PubMed系统与Loansome Doc、Infotrieve、Mediscope等3个原文传递机构建立了联系，在该系统中检索到的文献记录通过点击“Order”提交获取原文请求。其中Loansome Doc是美国医学图书馆联盟提供的原文订购服务系统。它根据用户请求，选择最近的机构通过电子邮件、传真等方式向用户提供原文，用户一般可在24小时内得到文献。PubMed方便的订购服务和LinkOut功能，为生物医学文献提供者与文献索取者之间构成联系的平台。目前，这种订购服务仅提供给已经在Loansome Doc注册的图书馆联盟会员，中国医学科学院图书馆可以提供这种订购服务。
3、Journal Browser
用左侧目条Journal Browser （杂志浏览器）可以检索PubMed收录期刊的详细信息，可检索到杂志名称、名称缩写或ISSN。链接到原文的杂志也包括在内。
4、MeSH Browser
MeSH (医学主题词表) 是美国国立医学图书馆编制的词汇表。通过左侧目条上的MeSH Browser超链，用户可以实现对最新版MeSH 词表的检索，了解每个主题词的释义信息和层次结构。如果输入的词在MeSH词表中没有，MeSH 浏览器将显示相关的MeSH 词汇。
5、Clinical Queries
为了帮助临床医生更有效地获取Medline数据库中有关疾病的病因、诊断、预防以及治疗等方面的信息，PubMed设置了Clinical Queries(临床查询)功能项，该功能项具备特殊的过滤器装置可限定在上述4个主题文献集中检索，以滤除部分不相关或相关性差的文献。在侧目条上点击Clinical Queries即可进入该页面。有治疗、诊断、病因、预防等四个类目可供选择。另外，还有针对检索精确性而设置的两个选项即：sensitivity（敏感性）和specificity（特异性），前者强调检索全面，而后者强调检索精确。以检索AIDS为例，选择sensitivity进行检索，获得的文献数远远超过选择specificity检索所获得的文献数。
注意： Clinical Queries功能仅适于上述四个类目主题文献的查找，要检索其他领域的文献不能在此页面中进行。
6、Citation Matcher
点击左侧目条上的citation matcher超链，可以让用户用参考文献信息来查找Medline数据库中的文献。可进行单条文献的查找，也可以同时查找多条文献。
检索实例
检索实例1：
查找1995年以后发表的有关醋氯芬酸药物临床试验方面的文献，为了保证检索结果的精确，将检索词限制在文献的题目中，且要求文献是用英文发表并带有文摘。简单的检索方法是先点击Limits界面，确定各项限制项，然后在检索框中输入检索词aceclofenac即可。
检索实例2：
欲检索2000年以后用日文发表的有关Crohn病药物治疗研究的文献，除可用上述的Limits检索方式外，还可在检索框中直接输入以下检索式：Crohn Disease [mh] AND drug therapy[sh]AND Japanese[la]AND 2000:2002[edat]
检索实例3：
欲检索降血脂药物吉非贝齐(Gemfibrozil)不良反应方面的文献，可采取以下检索式：
gemfibrozil AND adverse effects[sh]
也可以先点击preview/Index,在最下面的检索框中输入gemfibrozil,然后点击Index,可以浏览到PubMed数据库中收录的有关gemfibrozil的所有各副主题词类目下文章，可以发现有关副反应的文章共111篇，选中后点击preview键即可。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
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文献处理
1、显示
可以通过display下拉菜单选择显示方式。点击Show下拉菜单选择每屏的显示数目，再点击Display 按钮，PubMed 将重新按照新的命令进行显示。 点击选择页号显示结果，当前显示页号为红色，点击>> 可以查看以后的页号。PubMed 首先以summary 方式进行显示，各种显示格式所包括的内容如下： Summary — 包括：作者姓名、文章题目、出处、记录状态、语种、出版物类型、PMID。Brief — 包括：作者姓名、文章题目的前30个字母、PMID。Abstract —包括：出处、记录状态、文章题目、作者姓名、作者单位、文摘、出版物类型、缩写、注释、PMID等。 Citation —包括：出处、记录状态、文章题目、作者姓名、作者单位、文摘、出版物类型、缩写、注释、MeSH 词、化学物质名称、SI数据库索取号、基金号、PMID等。
2、保存
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3、打印
可以利用浏览器的打印键进行屏幕上内容的打印。如果要选择性地打印检索结果，可以先将所选的文献添加到Clipboard，然后再打印。
副主题词
副主题词(Subheadings)是由代表一些主题概念的MeSH词汇所组成，主要用来描述和限定检索词的主题领域（有关副主题词及其字段标识符见表1）。副主题词的字段标识符为[sh]。可以用Medline 的副主题词双字母缩写形式来检索，这样比采用全称检索更简便。例如：dh [sh]= diet therapy[sh]。
表 1 副主题词表及缩写形式
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副主题词名称 缩写 副主题词名称 缩写
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Abnormalities
Administration and Dosage
Adverse Effects
Agonists
Analogs and Derivatives
Analysis
Anatomy and Histology
Antagonists and Inhibitors
Biosynthesis
Blood Supply
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Chemical Synthesis
Chemically Induced
Chemistry
Classification
Complications
Congenital
Contraindications
Cytology
Deficiency
Diagnosis
Diagnostic Use
Diet Therapy
Drug Effects
Drug Therapy
Economics
Education
Embryology
Enzymology
Epidemiology
Ethnology
Etiology
Genetics
Growth and Development
History
Immunology
Injuries
Innervation
Instrumentation
Isolation and Purification
AB
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Parasitology
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Pathology
Pharmacokinetics
Pharmacology
Physiology
Physiopathology
Poisoning
Prevention and Control
Psychology
Radiation Effects
Radiography
Radionuclide Imaging
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Secretion
Standards
Statistics and Numerical Data
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Therapeutic Use
Therapy
Toxicity
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US
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VE
VI
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检索实例：检索哮喘药物治疗方面的文献，可以用：
asthma/drug therapy 或asthma/dt[sh]或asthma[mh]AND drug therapy[sh]等方式进行。
副主题词检索将自动地包括其他的下位词，如副主题词Therapy包括的下位词有：Diet Therapy、Drug Therapy等。如果希望关闭自动扩展功能，可以用句法 [sh:noexp]来实现,例如：therapy[sh:noexp]。
其他功能
1、链接
其功能主要体现在两个方面：一是对PubMed系统以外的外部信息的链接(Links)；二是系统内部相关信息的链接。
（1）相关文献(Related Aricles)链接 检索结果中每条记录的右侧都有“Related Aricles”超链接，点击该链接可以显示与本次检索结果相关的更多文献。PubMed 创建相关文献链接，是依据所检索的核心概念在被命中记录以外的其他文献的题目、文摘和MeSH 词中出现的情况、运用一定的权值算法来确定的，并依据相关程度进行排序。此功能可以帮助用户获得更多的相关文献。
（2）外部链接(Links) PubMed允许出版商、信息集成者、图书馆、生物学数据库、序列中心等提供的Wed资源与Medline数据库中的记录建立链接，这些外部资源通过LinkOut来实现。LinkOut超链接使检索者可以到信息提供者的站点上获取更多的相关信息。被链接的外部站点资源主要是杂志的原文(有些需要付费才能获得)。
（3）链接到NCBI数据库 此功能将Medline数据库与NCBI分子生物学数据库有机地结合起来，在Medline数据库检索命中文献涉及到分子生物学数据库中的信息如基因序列、蛋白质结构等自动建立链接，使用户很方便地通过超链调出相关信息。
（4）链接图书信息(Books) 是NCBI与图书出版商合作，将有关图书改写成Web版本并将其链接到PubMed中。该功能主要是为用户在检索中遇到不熟悉的概念提供背景资料。对于一些新概念和词语将有超链直接链接到书中的相关信息处。
2、原文传递服务
PubMed系统与Loansome Doc、Infotrieve、Mediscope等3个原文传递机构建立了联系，在该系统中检索到的文献记录通过点击“Order”提交获取原文请求。其中Loansome Doc是美国医学图书馆联盟提供的原文订购服务系统。它根据用户请求，选择最近的机构通过电子邮件、传真等方式向用户提供原文，用户一般可在24小时内得到文献。PubMed方便的订购服务和LinkOut功能，为生物医学文献提供者与文献索取者之间构成联系的平台。目前，这种订购服务仅提供给已经在Loansome Doc注册的图书馆联盟会员，中国医学科学院图书馆可以提供这种订购服务。
3、Journal Browser
用左侧目条Journal Browser （杂志浏览器）可以检索PubMed收录期刊的详细信息，可检索到杂志名称、名称缩写或ISSN。链接到原文的杂志也包括在内。
4、MeSH Browser
MeSH (医学主题词表) 是美国国立医学图书馆编制的词汇表。通过左侧目条上的MeSH Browser超链，用户可以实现对最新版MeSH 词表的检索，了解每个主题词的释义信息和层次结构。如果输入的词在MeSH词表中没有，MeSH 浏览器将显示相关的MeSH 词汇。
5、Clinical Queries
为了帮助临床医生更有效地获取Medline数据库中有关疾病的病因、诊断、预防以及治疗等方面的信息，PubMed设置了Clinical Queries(临床查询)功能项，该功能项具备特殊的过滤器装置可限定在上述4个主题文献集中检索，以滤除部分不相关或相关性差的文献。在侧目条上点击Clinical Queries即可进入该页面。有治疗、诊断、病因、预防等四个类目可供选择。另外，还有针对检索精确性而设置的两个选项即：sensitivity（敏感性）和specificity（特异性），前者强调检索全面，而后者强调检索精确。以检索AIDS为例，选择sensitivity进行检索，获得的文献数远远超过选择specificity检索所获得的文献数。
注意： Clinical Queries功能仅适于上述四个类目主题文献的查找，要检索其他领域的文献不能在此页面中进行。
6、Citation Matcher
点击左侧目条上的citation matcher超链，可以让用户用参考文献信息来查找Medline数据库中的文献。可进行单条文献的查找，也可以同时查找多条文献。
检索实例
检索实例1：
查找1995年以后发表的有关醋氯芬酸药物临床试验方面的文献，为了保证检索结果的精确，将检索词限制在文献的题目中，且要求文献是用英文发表并带有文摘。简单的检索方法是先点击Limits界面，确定各项限制项，然后在检索框中输入检索词aceclofenac即可。
检索实例2：
欲检索2000年以后用日文发表的有关Crohn病药物治疗研究的文献，除可用上述的Limits检索方式外，还可在检索框中直接输入以下检索式：Crohn Disease [mh] AND drug therapy[sh]AND Japanese[la]AND 2000:2002[edat]
检索实例3：
欲检索降血脂药物吉非贝齐(Gemfibrozil)不良反应方面的文献，可采取以下检索式：
gemfibrozil AND adverse effects[sh]
也可以先点击preview/Index,在最下面的检索框中输入gemfibrozil,然后点击Index,可以浏览到PubMed数据库中收录的有关gemfibrozil的所有各副主题词类目下文章，可以发现有关副反应的文章共111篇，选中后点击preview键即可。
